Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF103O00237 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF103O00237 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF103O00237 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF103O00237 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF103O00237 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF103O00237 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF103O00237 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF103O00237 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF103O00237 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF103O00237 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF103O00237 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF103O00237 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF103O00237 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF103O00237 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF103O00237 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF103O00237 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF103O00237 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF103O00237 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF103O00237 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF103O00237 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF103O00237 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF103O00237 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF103O00237 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF103O00237 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF103O00237 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF103O00237 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF103O00237 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF103O00237 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF103O00237 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF103O00237 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF103O00237 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF103O00237 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF103O00237 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF103O00237 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF103O00237 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF103O00237 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF103O00237 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF103O00237 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF103O00237 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF103O00237 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF103O00237 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF103O00237 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF103O00237 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF103O00237 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF103O00237 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF103O00237 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF103O00237 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF103O00237 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF103O00237 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF103O00237 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF103O00237 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF103O00237 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF103O00237 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF103O00237 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF103O00237 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF103O00237 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF103O00237 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF103O00237 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF103O00237 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF103O00237 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF103O00237 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF103O00237 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF103O00237 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF103O00237 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF103O00237 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF103O00237 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF103O00237 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF103O00237 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF103O00237 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF103O00237 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF103O00237 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF103O00237 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF103O00237 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF103O00237 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF103O00237 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF103O00237 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms