Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KT08 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KT08 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KT08 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KT08 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
J3KT08 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
J3KT08 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KT08 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KT08 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KT08 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3KT08 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KT08 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3KT08 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KT08 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KT08 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KT08 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KT08 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KT08 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KT08 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KT08 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3KT08 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KT08 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KT08 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KT08 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KT08 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KT08 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3KT08 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3KT08 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3KT08 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3KT08 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3KT08 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3KT08 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KT08 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KT08 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KT08 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KT08 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KT08 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KT08 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KT08 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KT08 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KT08 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KT08 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3KT08 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KT08 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KT08 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KT08 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KT08 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3KT08 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KT08 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KT08 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KT08 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KT08 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KT08 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KT08 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KT08 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KT08 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3KT08 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KT08 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3KT08 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3KT08 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KT08 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KT08 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3KT08 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms