Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BNH8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BNH8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BNH8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BNH8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNH8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNH8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNH8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNH8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNH8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNH8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNH8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNH8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNH8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BNH8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BNH8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BNH8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BNH8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BNH8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BNH8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BNH8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BNH8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BNH8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BNH8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BNH8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BNH8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BNH8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BNH8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BNH8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BNH8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BNH8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BNH8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BNH8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BNH8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BNH8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BNH8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BNH8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BNH8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BNH8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BNH8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNH8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNH8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNH8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNH8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNH8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BNH8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BNH8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BNH8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNH8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNH8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNH8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNH8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNH8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNH8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNH8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNH8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNH8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNH8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BNH8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNH8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNH8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNH8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNH8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BNH8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNH8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNH8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNH8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNH8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNH8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNH8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNH8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNH8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNH8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BNH8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNH8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNH8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNH8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNH8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNH8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNH8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNH8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BNH8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H3BNH8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BNH8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BNH8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BNH8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BNH8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BNH8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BNH8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BNH8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BNH8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BNH8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BNH8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BNH8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BNH8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BNH8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BNH8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNH8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNH8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNH8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms