Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP99D6REC4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP99D6REC4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP99D6REC4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms