Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TISP43B9A030 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TISP43B9A030 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TISP43B9A030 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TISP43B9A030 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TISP43B9A030 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TISP43B9A030 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TISP43B9A030 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TISP43B9A030 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TISP43B9A030 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TISP43B9A030 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TISP43B9A030 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TISP43B9A030 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms