Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KIF28PB7ZC32 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF28PB7ZC32 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KIF28PB7ZC32 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
KIF28PB7ZC32 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF28PB7ZC32 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms