Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PALM2-AKAP2B1ALY0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms