Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZK1P1A8MUH7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZK1P1A8MUH7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZK1P1A8MUH7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZK1P1A8MUH7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms