Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ88

SAGE2P, Putative SAGE1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAGE2PA6NJ88 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAGE2PA6NJ88 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SAGE2PA6NJ88 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAGE2PA6NJ88 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAGE2PA6NJ88 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAGE2PA6NJ88 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAGE2PA6NJ88 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAGE2PA6NJ88 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAGE2PA6NJ88 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAGE2PA6NJ88 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAGE2PA6NJ88 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms