Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GMNCA6NCL1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GMNCA6NCL1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GMNCA6NCL1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GMNCA6NCL1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms