Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DENND3A2RUS2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DENND3A2RUS2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND3A2RUS2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.58■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
DENND3A2RUS2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND3A2RUS2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND3A2RUS2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms