Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CCDC144AA2RUR9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC144AA2RUR9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCDC144AA2RUR9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC144AA2RUR9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCDC144AA2RUR9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms