Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR11

CENPVL1, Centromere protein V-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1A0A0U1RR11 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPVL1A0A0U1RR11 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPVL1A0A0U1RR11 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPVL1A0A0U1RR11 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPVL1A0A0U1RR11 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms