Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A0U1RQF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0U1RQF3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0U1RQF3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0U1RQF3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms