Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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