Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0J9YVX5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0J9YVX5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms