Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX49Q9Y6V7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX49Q9Y6V7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms