Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF6Q9Y4K3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAF6Q9Y4K3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms