Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms