Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMED5Q9Y3A6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms