Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP7AQ9Y3A4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms