Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HPS5Q9UPZ3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS5Q9UPZ3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms