Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAK1Q9UPV9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms