Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms