Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTF2Q9UNY4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms