Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX6Q9UNH7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms