Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CROTQ9UKG9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms