Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DCTN4Q9UJW0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCTN4Q9UJW0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms