Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXD3Q9UJU5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXD3Q9UJU5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms