Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIMS3Q9UJD0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms