Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGEF1Q9UJ41 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGEF1Q9UJ41 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGEF1Q9UJ41 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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RABGEF1Q9UJ41 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RABGEF1Q9UJ41 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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