Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNA3Q9UI47 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms