Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NPC1L1Q9UHC9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms