Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SH3BP4Q9P0V3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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