Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP7BPQ9NSQ0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms