Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RASSF1Q9NS23 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms