Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms