Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTPS2Q9NRF8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms