Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC31BQ9NQW1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC31BQ9NQW1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms