Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FZD3Q9NPG1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms