Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NPHS2Q9NP85 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NPHS2Q9NP85 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPHS2Q9NP85 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPHS2Q9NP85 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPHS2Q9NP85 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPHS2Q9NP85 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPHS2Q9NP85 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms