Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms