Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF1Q9H7N4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms