Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF3Q9H094 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms