Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms