Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMES1Q9C002 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms