Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM8Q9BZR9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms