Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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