Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms