Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA7Q9BWT1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA7Q9BWT1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms